Конечно, выходом из этой ситуации была бы постановка на учёт в ИФНС по месту прописки. Предположим, постоянная прописка физлица в Твери, а временная регистрация, по адресу которой он открывал ИП, - в столице. Как только закончится срок временной московской регистрации, предприниматель автоматически переводится на учёт в ИФНС Твери. Причём, особых трудностей это не представляет. Сейчас предпринимателя ставят на учёт в другую инспекцию, как только он меняет прописку, и от него не требуется никаких действий. Информация в ФНС поступает от Миграционной службы, без участия ИП. Больше читай тут: https://ur-konsalting.ru/stati/registratsiya-ip-ne-po-mestu-propiski.html