Да нет, особой разницы в работе не будет.
Если на уровени тестирования проверять, то различия в быстродействии будут заметны. А по факту - нет.
Но, тем не менее, я везде читал крайне настоятельный совет, чтобы на 64-битную операционку, ставили 64-битные программы.